包括協定団体
東京基督教大学は、以下のキリスト教関係団体や千葉ニュータウン地域の教育機関と連携しながら教育・運営を行っています。
包括協定締結
| 日本キングス・ガーデン |
| 認定こども園Rainbow Wings International |
| 新潟聖書学院 |
| お茶の水クリスチャン・センター |
| 高校生聖書伝道協会（hi-b.a.） |
| 新島学園中学校・高等学校 |
| 特定非営利活動法人ワールド・ビジョン・ジャパン |
| ハンガーゼロ 一般財団法人日本国際飢餓対策機構 |
| 株式会社創世ライフワークス社 |
| 日本福音宣教会（JEM） |
| 特定非営利活動法人 茨城YMCA |